Με τον οργανισμό του ιδρύματος ορίζονται η μορφή, η επωνυμία, η διοίκηση και εκπροσώπησή του, η περιουσία, η οικονομική του διαχείριση, τα μέσα και ο τρόπος εκτέλεσης του σκοπού και συμπληρώνονται τυχόν ελλείψεις των όρων της συστατικής πράξης.
τα κεφάλαια αυτοτελούς διαχείρισης εντάσσουν τον προϋπολογισμό τους στο προϋπολογισμό του φορέα στον οποίο υπάγονται, αλλά θα πρέπει να έχουν διακριτή οικονομική διαχείριση.
Επιτρέπεται η συγχώνευση ιδρυμάτων σε ένα ενιαίο ίδρυμα, κατόπιν συμφωνίας των διοικήσεων τους και έκδοσης Π.Δ. Η συμφωνία υπόκειται στον τύπο του συμβολαιογραφικού εγγράφου.
Τρίτοι, όπως συμβολαιογράφοι, γραμματείς δικαστηρίων, πρόξενοι, τράπεζες και άλλοι, όταν εμπλέκονται σε διαδικασίες κατάθεσης, δημοσίευσης διαθηκών, κληρονομιών, έχουν υποχρέωση να διαβιβάζουν-γνωστοποιούν αντίστοιχα αντίγραφα στο Υπουργείο Οικονομικών ή στην Αποκεντρωμένη Διοίκηση.